Comment régler les contrastes pour vos données avec R
Avant de pouvoir utiliser les R AOV () fonction avec vos données, vous feriez mieux de régler le contrastes vous allez utiliser. Les contrastes sont très souvent oubliés quand faire ANOVA (analyse des variables), mais ils aident généralement à interpréter le modèle et augmenter la précision de AOV () et les fonctions auxiliaires.
Quelles sont ces contrastes alors? Les facteurs sont convertis en un ensemble de variables, un de moins que le nombre de niveaux du facteur. Disons que vous avez un facteur de trois niveaux. R crée deux variables, et chaque niveau de l'élément est représentée par une combinaison de valeurs. Ces valeurs définissent la manière dont les coefficients du modèle doivent être interprétées.
Par défaut, R utilise les contrastes de traitement, comme vous pouvez le voir quand vous cochez l'option pertinente comme ceci:
> Options («contrastes») $ contrastsunordered ordonné "contr.treatment" "contr.poly"
Ici vous voyez que R utilise des contrastes différents facteurs pour ordonnées ou non. Ces contrastes sont en fait les fonctions de contraste. Ils reviennent une matrice avec les valeurs de contraste pour chaque niveau du facteur. Les contrastes par défaut d'un facteur de trois niveaux ressemblent à ceci:
> X lt; - facteur (c ('A', 'B', 'C'))> contr.treatment (X) B CA 0 0B 0C 1 0 1Les deux variables B et C sont appelés ainsi parce que la variable B a une valeur de 1 si le niveau de facteur est B- par ailleurs, il a une valeur de 0. La même chose vaut pour C. Le niveau A est représenté par deux zéros et appelé le niveau de référence. Dans un modèle d'un facteur, l'ordonnée à l'origine est la moyenne de UN.
Vous pouvez modifier ces contrastes en utilisant le même options () fonction, comme ceci:
> Options (contrastes = c ('contr.sum', 'contr.poly'))La fonction de contraste, contr.sum (), donne contrastes orthogonaux où vous comparez tous les niveaux à la moyenne globale. Vous pouvez obtenir plus d'informations sur ces contrastes sur la page d'aide ?contr.sum.
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